Le site de la commune est habité depuis l'âge de Fer (= 800 avant notre ère) comme l'attestent les fouilles réalisées dans les années 1950 sur les tumuli situés dans le Kastenwald.
A l'époque romaine le ban communal est un lieu de passage de plusieurs voies de communication.
Le nom du village apparaît pour la première fois en l'an 768 sous la forme "Suntor" dans une charte de donation de l'Abbaye de Saint-Denis. Une tradition orale (non vérifiée) dit que la première église du village aurait été construite à l'emplacement d'un ancien temple gallo-romain.
Au cours du Haut Moyen-Age le village change plusieurs fois de propriétaires, avant de tomber entre les mains des Sires de Horbourg. Les derniers tenants de cette famille vendent en 1321 tous leurs biens (y compris Sundhoffen) au Comte de Wurtemberg. A partir de cette date le village connaît le même destin que les autres villages du Comté (situé dans les actuels cantons d'Andolsheim et de Neuf-Brisach), et ceci jusqu'en 1790.
Dès le Xllème siècle, l'organisation foncière est marquée par l'existence de plusieurs grands corps de biens appartenant au Comte, ainsi qu'à différents couvents (Unterlinden, Dominicains, Augustins, Catherinettes de Colmar).
A la même époque disparaissent deux villages situés sur l'actuel ban communal ; Nordhofen décimé par la peste vers 1350, Blieschwihr ravagé par les Armagnacs en 1444. Les deux événements donnent d'ailleurs naissance, dans l'imagination populaire, à une légende transmise oralement jusqu'à notre époque, légende fournissant une explication des origines du village.
Au XVIème siècle les Comtes de Wurtemberg introduisent dans leurs domaines la Réforme. Dès 1538 Sundhoffen est érigé en paroisse luthérienne et pourvu d'un pasteur. Les Registres Paroissiaux remontent à 1560 et sont parmi les plus anciens du département. Malgré les vicissitudes de l'Histoire et la réintroduction imposée du culte catholique en 1685-86 par Louvois, l'écrasante majorité de la population reste fidèle à sa foi. Cette situation perdurera jusqu'aux années 1970 qui voient la population plus que doubler en dix ans.
Comme toute l'Alsace, Sundhoffen connut son lot de malheurs, pendant la Guerre de Trente Ans. Le village est dévasté par le Impériaux. Entre 1634 et 1645, il est pratiquement vidé de ses habitants (morts ou réfugiés à Colmar). A la fin des hostilités seules quelques familles reviennent.
Le village se relèvera péniblement de ses ruines, car la 2ème moitié du XVIlè siècle reste tout aussi agitée avec les campagnes de Louis XIV sur le Rhin. L'arrivée d'immigrés des cantons protestants suisses, ainsi que de Souabe permet la reconstitution de la population.
Le XVIllè siècle, en revanche, sera une période de forte expansion démographique avec son corollaire de création de quartiers nouveaux (les lotissements de l'époque, comme par exemple la rue de l'Ill). Une relative aisance règne alors à Sundhoffen. Un nouveau presbytère protestant est construit en 1769 et la paroisse est si richement dotée que son poste pastoral sera le plus convoité, après celui de Riquewihr.
L'avènement de la Révolution provoque de gros bouleversements dans l'organisation de la cité (élection des municipalités qui remplacent les Schulthei[3e) ainsi qu'une réorganisation foncière (vente des biens nationaux).
L'expansion démographique continue (836 habitants en 1792, 900 en 1800, 1165 en 1820, 1250 en 1845). Mais elle engendre aussi des problèmes de ressources et d'emploi qui vont aboutir à partir de 1850 à un exode rural très important vers Colmar (en 1903 il n'y a plus que 933 habitants).
Le XIXÈ siècle verra cependant la réalisation de gros chantiers. Une nouvelle église est construite en 1832. En 1844, le nouveau pont sur l'Ill est achevé (construit sur le modèle de celui du Carrousel à Paris, il remplace l'ancien pont en bois). En 1857, c'est la mairie-école qui est érigée. Entre 1850 et 1880 les travaux d'endiguement de l'Ill mobilisent eux aussi beaucoup de monde et d'argent. Enfin, en 1899-1900, l'école primaire est construite. Par ailleurs Sundhoffen a la chance de voir passer sur son ban en 1875 la nouvelle voie ferrée de Colmar à Fribourg, avec implantation d'une gare.
Le village garda cependant, et ce jusque vers 1970, une vocation exclusivement agricole et artisanale.
La 1ère moitié du XXè siècle fut marquée par la saignées des deux guerres mondiales (23 victimes en 1914-1918, 36 en 1939-1945). Elle voit aussi l'éclosion du mouvement associatif, si caractéristique de la commune, et la construction en 1928 par les musiciens de la salle des fêtes (actuellement intégrée au C.S.C.S.). La période allant de 1945 à 1955 fut marquée par la réparation des dommages de guerre (reconstruction du pont de l'Ill, etc.).
Elle vit aussi l'ouverture de la première classe maternelle au village.
Le remembrement rural en 1959 et la percée de la rue du Neuland en 1961 marquèrent l'ouverture sur une nouvelle ère qui, en l'espace d'une vingtaine d'années, transformera en profondeur le village et ses habitudes avec la création des nombreux lotissements.
Zones urbanisées en 1951, 1976, 1992
(Source: JM. SCHULLER, Maire de Sundhoffen).